Završni korak u procesu dobivanja ekstra djevičanskog maslinovog ulja jest skladištenje ulja, stoga mu treba pristupiti posebno pažljivo i odgovorno jer se nepravilnim čuvanjem može znatno narušiti njegova kvaliteta. Veće količine prerađenog ulja čuvaju se u hladnim prostorima, u spremnicima izrađenim od nehrđajućeg čelika (inoksa) s konusnim dnom, zaštićenih od naglih promjena temperature. Kako bi kontakt ulja sa zrakom bio što manji, ovi spremnici moraju biti što puniji. Male količine ulja ili pak količine dovoljne za kućnu upotrebu potrebno je čuvati u tamnim staklenim bocama, zaštićene od svjetla i povišenih temperatura. Ulje se nikako ne smije čuvati u plastičnim bocama.
